Притеснявате ли се да проектирате машина за кладограми от масата? Ето някои създатели на кладограми, които могат да помогнат много.
Когато бяхме деца, всички сме чели в биологията, че всички са свързани помежду си по някакъв начин, като например маймуните са предци на човешките същества, ние сме свързани с хранителната верига и много други.
Дървото на кладограмата представлява родови връзки между организмите въз основа на ДНК последователности, физически черти и фенотипове. Това е еволюционно дърво, което позволява да се категоризира всяка клада въз основа на подобни характеристики, еволюционни разкази и адаптация. Най-вероятната хипотеза се решава въз основа на сравнените и начертани кладограми.
Той използва линии, за да представи посоките на кладата с други предци или групи организми. Човек може лесно да проследи линиите до началния и крайния клад, представляващ хипотетични предци.
Ако е необходимо, организмите се разделят на базата на молекулярно и морфологично ниво, като се използват поведенчески данни (за животни). Алгоритмите за генериране на Cladogram се използват за изпълнение на оптимизационни задачи въз основа на входни данни. Целта е да се реши проблемът с глобалния минимум, като се предпочита подходът на симулираното отгряване, който гарантира намирането на оптимално решение.
С това казано, ето списъкът с инструменти за кладограма, които можете да изберете.
Съдържание
Създателски
Лесно визуализирайте отношенията с Създателски Създател на кладограми за представяне на връзката между видовете. Създайте помощ за ефективно идентифициране и визуализиране на филогенетичните връзки. Това е чудесен начин за представяне на различни биологични видове с характеристики като:
- PDF, SVG и PNG изображения за експортиране за печат и споделяне
- Множество шаблони за филогенетична и кладограма диаграма
- Лесно визуализиране на връзки върху платно
Той предлага обширни библиотеки с форми, включително дихотомични ключове, хранителни мрежи, филогенетични дървета и множество шаблони за групиране на организми. Инструментът предоставя прости функции за плъзгане и пускане за създаване на връзки без усилие с разширено форматиране на текст и конфигурируеми цветови теми.
Creative предлага плъзгане и пускане на животински изображения и динамични конектори за безпроблемно разширяване, завъртане и преоразмеряване на диаграми. Създавайте динамични кладограми с вградени изображения на Google, за да централизирате изследователски данни, пълни с безкрайно платно, универсално търсене в пълен текст, вградени инструменти и гъвкава таблица.
Лесно е да си сътрудничите с други, като използвате курсори в реално време, секции за коментари за дискусии и видеоконференции.
Създател на прозрения
Създател на прозрения е опростена форма за изграждане на модели в уеб браузъри. Човек може лесно да създава случайни циклични диаграми и богати картини, като прави симулации за всякакви изисквания с Insight Maker. Помага за бързото стимулиране на взаимодействието между населението и определя поведението на агента.
Insight Maker е лесен за използване:
- Стартирайте инструмента в уеб браузър, без да са необходими добавки или изтегляния
- Поставете идеите си върху платното, за да създадете симулационни модели, богати картини и прозрения
- Използвайте симулационни алгоритми, за да започнете с базирано на агенти и системно-динамично моделиране
- Сътрудничете с екипа и им позволете да ви изпратят информация и за дизайните
- Направете моделите безплатно и впрегнете силата на креативността
Освен това потребителите могат да добият представа за кладограмите и да проверят върху какво работят другите. Това ще им помогне да обмислят и да намерят най-доброто решение.
Гълифорд
Използвайте SimpleClade с Гълифорд да излезе с идеален кладистичен анализ. Той предлага графичен потребителски интерфейс за проектиране на лесен метод на работа в класа по палеонтология. Заедно с това, инструментът е лесен за използване, инсталирайте софтуера и започнете да го използвате незабавно.
Потребителите могат да създадат свой CSV файл с данни и да започнат да генерират класове. Целият процес на използване на клетката включва диференциращата стойност, която човек може да научи бързо. Потребителите могат да маркират клас „НЕИЗПОЛЗВАН“, който не използват, и да въведат стойността на други класове.
Потребителите могат да започнат с програмни операции и да изберат възли, които могат да обяснят тяхното запитване, да променят връзката, ако е необходимо, да изчислят статистика за пестеливост, да свържат хоризонтално коренно стъбло за външната група и да видят промяната на състоянието на характеристиките.
IUBio
IUBio е друг популярен инструмент, използван за създаване на кладограми, еврограми, свупограми, кривограми, фенограми и диаграми на дървета. Той е лесен за използване, качете дървовидния файл (или поставете URL адреса), споменете заглавието и изпратете подробностите.
Потребителите могат също да изберат допълнителните опции в IUBio, за да получат желания резултат, като основен URL адрес за етикети, стил, шрифт, размер и т.н. Той също така позволява на потребителите да избират от растежа на дървото и позицията на възела, за да му придадат добър вид.
Онлайн инструментът се занимава с няколко неща като артроподи, DroSpeGe, enGenes, wFleaBase и много други. Предлага публичен достъп на потребителите в областта на биоинформатиката и молекулярната биология. IUBio включва геном на Drosophila, анализ на последователности, преобразувания на био последователности и редактори за всяка употреба.
Заключение
Създателите на кладограми от дървета позволяват да се представят еволюционните линии с клонове и броя на генетичните промени за нуклеотидни замествания. Също така е лесно да се представят подстанции въз основа на % промени в последователността.
Заедно с това, дървовидната структура трябва да се поддържа, когато се фокусира върху клони и възли (вътрешни и външни възли – листа и върхове). Диаграмата също така включва молекулярния часовник, за да излезе с крайните общи предци.
Започнете с маркера за кладограма, за да получите желаните резултати.